Управление МДОУ "Детский сад № 13 "Василёк" осуществляется на основе сочетания принципов единоначалия и коллегиальности.
Единоличным исполнительным органом учреждения является заведующий
Коллегиальные органы управления:
Общее собрание работников
Педагогический совет
Совет учреждения
Совет родителей
МДОУ «Детский сад № 13 «Василёк» структурных подразделений не имеет.